Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms