Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf13O54965 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms