Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms