Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms