Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms