Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1dO35473 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1dO35473 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1dO35473 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1dO35473 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1dO35473 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1dO35473 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1dO35473 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1dO35473 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1dO35473 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms