Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TnxbO35452 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TnxbO35452 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms