Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Prrt1O35449 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Prrt1O35449 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Prrt1O35449 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Prrt1O35449 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Prrt1O35449 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Prrt1O35449 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Prrt1O35449 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Prrt1O35449 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Prrt1O35449 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Prrt1O35449 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Prrt1O35449 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Prrt1O35449 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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