Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms