Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxd2O35392 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms