Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppef2O35385 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms