Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Slc18a3O35304 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Slc18a3O35304 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Slc18a3O35304 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc18a3O35304 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc18a3O35304 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc18a3O35304 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms