Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms