Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnih2O35089 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnih2O35089 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms