Protein–RNA interactions for Protein: O08709

Prdx6, Peroxiredoxin-6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdx6O08709 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdx6O08709 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdx6O08709 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms