Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltaO08585 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltaO08585 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltaO08585 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltaO08585 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltaO08585 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltaO08585 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltaO08585 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltaO08585 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltaO08585 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltaO08585 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltaO08585 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltaO08585 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltaO08585 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltaO08585 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltaO08585 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CltaO08585 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltaO08585 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltaO08585 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltaO08585 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltaO08585 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltaO08585 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltaO08585 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltaO08585 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltaO08585 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltaO08585 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltaO08585 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltaO08585 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltaO08585 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CltaO08585 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltaO08585 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltaO08585 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CltaO08585 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CltaO08585 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltaO08585 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltaO08585 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltaO08585 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltaO08585 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltaO08585 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltaO08585 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CltaO08585 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltaO08585 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CltaO08585 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CltaO08585 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltaO08585 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltaO08585 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltaO08585 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltaO08585 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltaO08585 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltaO08585 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltaO08585 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltaO08585 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltaO08585 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltaO08585 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltaO08585 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltaO08585 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltaO08585 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltaO08585 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltaO08585 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltaO08585 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltaO08585 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CltaO08585 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltaO08585 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltaO08585 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltaO08585 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltaO08585 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltaO08585 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CltaO08585 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CltaO08585 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CltaO08585 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CltaO08585 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CltaO08585 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CltaO08585 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CltaO08585 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CltaO08585 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CltaO08585 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CltaO08585 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltaO08585 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltaO08585 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltaO08585 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltaO08585 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltaO08585 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltaO08585 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CltaO08585 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltaO08585 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms