Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsmbO08540 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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