Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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