Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IfnabL7MTU6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IfnabL7MTU6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IfnabL7MTU6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IfnabL7MTU6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IfnabL7MTU6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IfnabL7MTU6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IfnabL7MTU6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IfnabL7MTU6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IfnabL7MTU6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms