Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21310J3QQ23 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21310J3QQ23 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21310J3QQ23 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21310J3QQ23 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21310J3QQ23 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21310J3QQ23 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21310J3QQ23 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21310J3QQ23 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21310J3QQ23 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm21310J3QQ23 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21310J3QQ23 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm21310J3QQ23 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm21310J3QQ23 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21310J3QQ23 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21310J3QQ23 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Gm21310J3QQ23 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm21310J3QQ23 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm21310J3QQ23 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm21310J3QQ23 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm21310J3QQ23 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm21310J3QQ23 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm21310J3QQ23 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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