Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21976J3QNN2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms