Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH3

Gm21788, Predicted gene, 21788, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21788J3QNH3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21788J3QNH3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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