Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms