Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3336J3QMQ6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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