Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm3727J3QM54 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm3727J3QM54 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3727J3QM54 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3727J3QM54 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3727J3QM54 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm3727J3QM54 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3727J3QM54 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3727J3QM54 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3727J3QM54 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm3727J3QM54 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3727J3QM54 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm3727J3QM54 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3727J3QM54 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm3727J3QM54 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3727J3QM54 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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