Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm6594J3QM43 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm6594J3QM43 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm6594J3QM43 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm6594J3QM43 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm6594J3QM43 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm6594J3QM43 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm6594J3QM43 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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