Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
7530416G11RikJ3QJX6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms