Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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