Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms