Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms