Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms