Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms