Protein–RNA interactions for Protein: G3X996

Zfp846, RIKEN cDNA 2210010B09, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp846G3X996 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp846G3X996 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp846G3X996 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms