Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610008E11RikG3X964 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
2610008E11RikG3X964 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms