Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a3G3X939 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms