Protein–RNA interactions for Protein: G3UZF1

Gm20509, Predicted gene 20509 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20509G3UZF1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm20509G3UZF1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20509G3UZF1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms