Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r167G3UW71 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r167G3UW71 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r167G3UW71 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r167G3UW71 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r167G3UW71 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r167G3UW71 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r167G3UW71 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms