Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Farp1F8VPU2 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms