Protein–RNA interactions for Protein: F7D8Y4

Gm17079, Predicted gene 17079 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17079F7D8Y4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17079F7D8Y4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17079F7D8Y4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17079F7D8Y4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17079F7D8Y4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17079F7D8Y4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17079F7D8Y4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms