Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms