Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm28038F7BCN9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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