Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6482F6YHC1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms