Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms