Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms