Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzd7E9Q9W7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms