Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rdh16f1E9Q9P8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rdh16f1E9Q9P8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rdh16f1E9Q9P8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rdh16f1E9Q9P8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rdh16f1E9Q9P8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rdh16f1E9Q9P8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
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Rdh16f1E9Q9P8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rdh16f1E9Q9P8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rdh16f1E9Q9P8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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