Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdhr2E9Q7P9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdhr2E9Q7P9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms