Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.2 ms