Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn2r48E9Q5D8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms