Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms